cfDNA (circulating-free cell DNA), 又稱(chēng)循環(huán) DNA 或無(wú)細胞DNA, 是指存在于血漿或血清的細胞外DNA;
ctDNA(circulating tumor DNA)攜帶了腫瘤基因組5hmC羥甲基化信息,
并且在近幾年5hmC已經(jīng)作為一種重要癌癥篩查標志物的研究,具有重要的臨床價(jià)值。
完整解決方案,服務(wù)每一個(gè)項目
艾斯基因專(zhuān)注表觀(guān)組學(xué)10年,提供專(zhuān)業(yè)的DNA羥甲基化整體解決方案;
已經(jīng)完成1000+例樣本cfDNA羥甲基化項目經(jīng)驗;
解決從血液采集保存、cfDNA分離提取(>90%得率),
低至15ng輸入量的微量羥甲基化捕獲文庫構建,
多方位助力cfDNA羥甲基化biomarker篩選及轉化應用。
樣本要求
樣本類(lèi)型 | 樣本要求 |
血漿/血清cfDNA | 建議提供1-4ml血漿/血清, 或者>15ng cfDNA |
備注:用封口膜密封樣品; 干冰運輸 |
cfDNA樣本準備注意事項
在體內cfDNA在血漿里核酸酶的作用下,不斷降解消失,
同時(shí)新的ctDNA和cfDNA進(jìn)入血漿中,維持一定的動(dòng)態(tài)和半衰期;
抽血離體之后ctDNA會(huì )繼續降解、含量逐步減少,而來(lái)自白血細胞的cfDNA持續進(jìn)去血漿,進(jìn)而稀釋ctDNA濃度,降低檢測信號。
因此,在采血、血漿分離及保存運輸都會(huì )影響數據的質(zhì)量
抽血及暫存注意事項 | |
EDTA抗凝管 | 在2-8度冰箱暫放;在8小時(shí)內低溫離心分離血漿 |
Streck等采血管 | 在2-8度冰箱或者常溫暫放;在48小時(shí)內離心分離血漿 |
注意:全血樣本在分離出血漿之前,千萬(wàn)不要冷凍保存 | |
血漿分離 | |
采取兩輪離心分離血漿,4℃條件下以 1600g 離心10min, 4℃條件下以 16000g 離心10min; 要求EDTA抗凝管采血管需要低溫條件離心; Streck等采血管建議低溫離心,也可以常溫離心,不受到影響 | |
保存及運輸 | |
分離的血漿存放于-80℃冰箱保存(3年內都可以); 使用干冰運輸。 | |
cfDNA提取產(chǎn)量 | |
cfDNA的含量存在較大的波動(dòng)及異質(zhì)性; 一般正常人及腫瘤早期, 5-15ng/ml血漿; 腫瘤晚期或者化療等病人, cfDNA濃度顯著(zhù)提高 |
為了結果的穩定性和一致性,
我們建議使用Streck等采血管替代普通的 EDTA抗凝管,
對于合作項目,艾斯基因提供專(zhuān)門(mén)的采血管!
復制成功
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