DNA甲基化隊列研究
DNA甲基化(DNA methylation)是研究更深入的表觀(guān)遺傳調控機制之一,被認為是第五個(gè)堿基,
在維持正常細胞的功能、基因組結構穩定、遺傳印記、胚胎發(fā)育等具有至關(guān)重要的作用;
DNA甲基化異常普遍參與人體衰老、神經(jīng)退行性病變、自身免疫性疾病、代謝及循環(huán)系統疾病、慢病及腫瘤發(fā)生發(fā)展過(guò)程。
作為新型生物標志物,甲基化隊列研究在國際上已有大量文獻報道,國內甲基化隊列研究近年來(lái)趨為熱點(diǎn)。
圖1 DNA甲基化與人類(lèi)疾病健康息息相關(guān)
甲基化隊列研究痛點(diǎn):檢測成本高、轉化應用難
生物樣本庫隊列研究的明顯特征是樣本數量巨大,從幾百樣本的小隊列到上萬(wàn)樣本的大隊列。
目前,DNA甲基化檢測的金標準是單堿基分辨率的亞硫酸鹽測序,
包括全基因組亞硫酸鹽測序WGBS、簡(jiǎn)化甲基化測序RRBS及Illumina 850K/935K甲基化芯片等常見(jiàn)的技術(shù)方法;
針對人類(lèi)基因組,這些方法成本較高,制約了動(dòng)輒成百上千的大樣本范圍的檢測,因此只適合中小樣本數量篩選甲基化biomarker。
艾斯基因建立了NGS和甲基化芯片系統,包括WGBS,強化版RRBS, 甲基化芯片(935K芯片)及全譜甲基化測序。
除了全基因組甲基化測序技術(shù)等研究手段,如何進(jìn)行大樣本甲基化biomarker的檢測及驗證,
則需要更為精確和低成本的中通量的靶向甲基化檢測方案。
基于亞硫酸鹽多重PCR捕獲重要技術(shù)的目標區域甲基化測序Targeted Bisulfite Sequencing (TBSeq Panel),
普遍用于隊列大樣本多位點(diǎn)的甲基化Biomarker驗證及臨床轉化應用。
艾斯基因推出Acegen TBSeq Panel定制技術(shù)服務(wù),
攜『中小樣本高通量篩選 + 大樣本中通量驗證方案』,將大樣本隊列甲基化研究帶進(jìn)百元級別時(shí)代,助力臨床轉化應用。
(中通量驗證平臺)
面對少量確定的Biomarker,低通量檢測從經(jīng)濟,時(shí)間和儀器便攜性上都是更合適的檢測方法。
艾斯基因的qPCR平臺和ddPCR平臺,通過(guò)測定驗證后的Biomarker甲基化,可用于開(kāi)發(fā)試劑盒,用于臨床快速診斷。
(低通量轉化平臺)
圖6 艾斯基因甲基化隊列項目整體解決方案
C100千萬(wàn)資助計劃:
艾斯基因致力于表觀(guān)組學(xué)技術(shù)創(chuàng )新及轉化應用;為促進(jìn)DNA甲基化在大規模隊列研究的順利啟動(dòng),
艾斯基因正式面向全國科研工作者啟動(dòng)C100計劃『千萬(wàn)元大樣本隊列甲基化研究資助計劃』,
該計劃重點(diǎn)支持以表觀(guān)甲基化為主要研究對象的大隊列項目(項目樣本數量不低于200例)。
C100計劃為每個(gè)項目輕松啟動(dòng)資助10萬(wàn)元;
為助力高水平學(xué)術(shù)成果及轉化應用,艾斯基因10年以上經(jīng)驗技術(shù)團隊100%全程參與:
從科學(xué)問(wèn)題探討、項目方案設計到執行全流程參與的數據深度挖掘服務(wù)。
C100計劃資助范圍普遍覆蓋腫瘤、慢病、衰老、檢驗科,婦科及公衛系統;
研究方向覆蓋分子分型、早篩早檢、伴隨診斷、MRD及預后復發(fā)監測等。
復制成功
×