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    張老師

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    5hmC化學(xué)捕獲測序(5hmC Seal)

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    羥甲基化5hmC是被認為是哺乳動(dòng)物基因組上的第六堿基,在發(fā)育、衰老、神經(jīng)退行性疾病、復雜疾病及腫瘤發(fā)生過(guò)程中起重要作用
    產(chǎn)品介紹

    羥甲基化5hmC是被認為是哺乳動(dòng)物基因組上的第六堿基,在發(fā)育、衰老、神經(jīng)退行性疾病、復雜疾病及腫瘤發(fā)生過(guò)程中起重要作用;

    并且在較近幾年5hmC已經(jīng)作為一種重要癌癥篩查標志物的研究,具有重要的臨床價(jià)值;

    5hmC化學(xué)捕獲測序(5hmC-Seal)通過(guò)點(diǎn)擊化學(xué)、生物素標記捕獲等原理(Nat Biotechnol. 2011;29(1):68-72),

    減少了基于亞硫酸鹽測序對DNA損傷,降低了DNA輸入量的要求,

    滿(mǎn)足不同樣本類(lèi)型包括血漿cfDNA的全基因組范圍羥甲基化檢測;

    普遍用于: 1) 發(fā)育和疾病甲基化機制研究; 2) 復雜疾病與腫瘤分子分型與診斷預后; 3) cfDNA羥甲基化檢測、液體活檢等臨床應用。

    重點(diǎn)技術(shù)及質(zhì)控,用心服務(wù)每一個(gè)項目

    專(zhuān)注表觀(guān)組學(xué)10年,提供專(zhuān)業(yè)有價(jià)值的羥甲基化完整解決方案;

    較早開(kāi)發(fā)羥甲基化測序技術(shù)的團隊之一, 國內較早推出多種組合的羥甲基化解決方案;

    從樣本采集、cfDNA提取、建庫測序的完整cfDNA羥甲基化檢測方案;

    低至5ng血漿cfDNA的5hmC Seal文庫構建重點(diǎn)技術(shù);

    自動(dòng)化樣本處理、建庫及分析流程,保障高效周期,40天極速交付;

    已完成多種腫瘤組織、cfDNA及哺乳動(dòng)物羥甲基化測序及分析;

    助力客戶(hù)在Genome biology, Epigenetics等雜志發(fā)表多篇論文。

    樣本類(lèi)型和要求

    樣本類(lèi)型

    樣本要求

    基因組DNA

    總量≥ 3ug; 濃度≥ 30ng/ul; 基于Qubit定量

    血漿/血清/cfDNA

    建議提供2-4ml血漿/血清, 或者>15ng cfDNA

    細胞、全血、動(dòng)物組織等

    按照送樣要求準備

    備注:用封口膜密封樣品; 干冰運輸

    數據分析

    Seal-seq

    分析內容

    備注

    標準分析

    1、測序數據質(zhì)量評估

    過(guò)濾掉低質(zhì)量數據,保證數據質(zhì)量

    2、與參考基因組比對

    測序Reads 在基因組上的分布

    3、5hmC Peak峰Calling

    5hmC富集區域鑒定

    4、5hmC Peak圖譜分析

    5hmC Peak在基因組,染色體,功能元件上的分布

    6、組間差異5hmC Peak分析

    尋找DhMR及注釋

    7、差異5hmC Peak基因分析

    相關(guān)基因GO,KEGG富集分析

    高級分析

    8、多組學(xué)整合關(guān)聯(lián)分析

    例如與轉錄組關(guān)聯(lián)分析

    9、其它定制化分析

    結合課題背景亮點(diǎn)挖掘


    5hmC化學(xué)捕獲測序(5hmC Seal)

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    0755-28507994
    產(chǎn)品介紹

    羥甲基化5hmC是被認為是哺乳動(dòng)物基因組上的第六堿基,在發(fā)育、衰老、神經(jīng)退行性疾病、復雜疾病及腫瘤發(fā)生過(guò)程中起重要作用;

    并且在較近幾年5hmC已經(jīng)作為一種重要癌癥篩查標志物的研究,具有重要的臨床價(jià)值;

    5hmC化學(xué)捕獲測序(5hmC-Seal)通過(guò)點(diǎn)擊化學(xué)、生物素標記捕獲等原理(Nat Biotechnol. 2011;29(1):68-72),

    減少了基于亞硫酸鹽測序對DNA損傷,降低了DNA輸入量的要求,

    滿(mǎn)足不同樣本類(lèi)型包括血漿cfDNA的全基因組范圍羥甲基化檢測;

    普遍用于: 1) 發(fā)育和疾病甲基化機制研究; 2) 復雜疾病與腫瘤分子分型與診斷預后; 3) cfDNA羥甲基化檢測、液體活檢等臨床應用。

    重點(diǎn)技術(shù)及質(zhì)控,用心服務(wù)每一個(gè)項目

    專(zhuān)注表觀(guān)組學(xué)10年,提供專(zhuān)業(yè)有價(jià)值的羥甲基化完整解決方案;

    較早開(kāi)發(fā)羥甲基化測序技術(shù)的團隊之一, 國內較早推出多種組合的羥甲基化解決方案;

    從樣本采集、cfDNA提取、建庫測序的完整cfDNA羥甲基化檢測方案;

    低至5ng血漿cfDNA的5hmC Seal文庫構建重點(diǎn)技術(shù);

    自動(dòng)化樣本處理、建庫及分析流程,保障高效周期,40天極速交付;

    已完成多種腫瘤組織、cfDNA及哺乳動(dòng)物羥甲基化測序及分析;

    助力客戶(hù)在Genome biology, Epigenetics等雜志發(fā)表多篇論文。

    樣本類(lèi)型和要求

    樣本類(lèi)型

    樣本要求

    基因組DNA

    總量≥ 3ug; 濃度≥ 30ng/ul; 基于Qubit定量

    血漿/血清/cfDNA

    建議提供2-4ml血漿/血清, 或者>15ng cfDNA

    細胞、全血、動(dòng)物組織等

    按照送樣要求準備

    備注:用封口膜密封樣品; 干冰運輸

    數據分析

    Seal-seq

    分析內容

    備注

    標準分析

    1、測序數據質(zhì)量評估

    過(guò)濾掉低質(zhì)量數據,保證數據質(zhì)量

    2、與參考基因組比對

    測序Reads 在基因組上的分布

    3、5hmC Peak峰Calling

    5hmC富集區域鑒定

    4、5hmC Peak圖譜分析

    5hmC Peak在基因組,染色體,功能元件上的分布

    6、組間差異5hmC Peak分析

    尋找DhMR及注釋

    7、差異5hmC Peak基因分析

    相關(guān)基因GO,KEGG富集分析

    高級分析

    8、多組學(xué)整合關(guān)聯(lián)分析

    例如與轉錄組關(guān)聯(lián)分析

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