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包含了原450K芯片91%的位點(diǎn)，又增加了413,745個(gè)位點(diǎn)(總共853,307個(gè)CpG位點(diǎn))產(chǎn)品介紹Illumina甲基化芯片Infinium MethylationEPIC BeadChip(簡(jiǎn)稱(chēng)850K甲基化芯片)，
在原450K芯片的基礎上，推出了新一代的DNA甲基化芯片;
包含了原450K芯片91%的位點(diǎn)，又增加了413,745個(gè)位點(diǎn)(總共853,307個(gè)CpG位點(diǎn));
850K芯片覆蓋基因啟動(dòng)子區、基因編碼區、CpG島以及增強子區;
普遍用于復雜疾病甲基化研究，以及大樣本EWAS研究的。
850K芯片技術(shù)參數
針對人基因組，檢測853,307個(gè)CpG位點(diǎn)，覆蓋CpG島、啟動(dòng)子、編碼區、開(kāi)放染色質(zhì)和增強子;
同時(shí)采用Infinium I及II探針設計，使檢測范圍更大化;
單堿基分辨率，可以直接檢測到發(fā)生甲基化的確切位點(diǎn);
重復性較高，技術(shù)重復相關(guān)性以及與450K相同探針間的相關(guān)性R2 > 0.98;
起始模板量低，只需 250ng;適用于FFPE樣本。
樣本類(lèi)型和要求
樣本類(lèi)型
樣本要求
人基因組DNA
總量≥ 2ug; 濃度≥ 30ng/ul; 基于Qubit定量
細胞、全血、新鮮冷凍組織等
按照送樣要求準備
備注：用封口膜密封樣品; 干冰運輸
信息分析
850K芯片
分析內容
標準分析
1．原始數據預處理
2．數據歸一化（甲基化位點(diǎn)總表，含注釋信息)
3．QC結果（beta值密度曲線(xiàn)，聚類(lèi)圖，PCA圖，相關(guān)性圖）
4．差異甲基化位點(diǎn)（含注釋信息）
5．差異甲基化位點(diǎn)的染色體分布
6．差異甲基化位點(diǎn)的基因功能注釋與富集
7．差異甲基化位點(diǎn)的熱圖展示
高級分析
8、特定基因組區段的DMR展示
9、甲基化與轉錄的關(guān)聯(lián)分析
10、其它定制化分析
產(chǎn)品介紹Illumina甲基化芯片Infinium MethylationEPIC BeadChip(簡(jiǎn)稱(chēng)850K甲基化芯片)，
在原450K芯片的基礎上，推出了新一代的DNA甲基化芯片;
包含了原450K芯片91%的位點(diǎn)，又增加了413,745個(gè)位點(diǎn)(總共853,307個(gè)CpG位點(diǎn));
850K芯片覆蓋基因啟動(dòng)子區、基因編碼區、CpG島以及增強子區;
普遍用于復雜疾病甲基化研究，以及大樣本EWAS研究的。
850K芯片技術(shù)參數
針對人基因組，檢測853,307個(gè)CpG位點(diǎn)，覆蓋CpG島、啟動(dòng)子、編碼區、開(kāi)放染色質(zhì)和增強子;
同時(shí)采用Infinium I及II探針設計，使檢測范圍更大化;
單堿基分辨率，可以直接檢測到發(fā)生甲基化的確切位點(diǎn);
重復性較高，技術(shù)重復相關(guān)性以及與450K相同探針間的相關(guān)性R2 > 0.98;
起始模板量低，只需 250ng;適用于FFPE樣本。
樣本類(lèi)型和要求
樣本類(lèi)型
樣本要求
人基因組DNA
總量≥ 2ug; 濃度≥ 30ng/ul; 基于Qubit定量
細胞、全血、新鮮冷凍組織等
按照送樣要求準備
備注：用封口膜密封樣品; 干冰運輸
信息分析
850K芯片
分析內容
標準分析
1．原始數據預處理
2．數據歸一化（甲基化位點(diǎn)總表，含注釋信息)
3．QC結果（beta值密度曲線(xiàn)，聚類(lèi)圖，PCA圖，相關(guān)性圖）
4．差異甲基化位點(diǎn)（含注釋信息）
5．差異甲基化位點(diǎn)的染色體分布
6．差異甲基化位點(diǎn)的基因功能注釋與富集
7．差異甲基化位點(diǎn)的熱圖展示
高級分析
8、特定基因組區段的DMR展示
9、甲基化與轉錄的關(guān)聯(lián)分析
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