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  • 深圳市艾斯基因科技有限公司
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    張老師

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    深圳市光明區鳳凰街道鳳凰社區招商局光明科技園A4棟13樓

    Illumina人850K甲基化芯片

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    包含了原450K芯片91%的位點(diǎn),又增加了413,745個(gè)位點(diǎn)(總共853,307個(gè)CpG位點(diǎn))
    產(chǎn)品介紹

    Illumina甲基化芯片Infinium MethylationEPIC BeadChip(簡(jiǎn)稱(chēng)850K甲基化芯片),

    在原450K芯片的基礎上,推出了新一代的DNA甲基化芯片;

    包含了原450K芯片91%的位點(diǎn),又增加了413,745個(gè)位點(diǎn)(總共853,307個(gè)CpG位點(diǎn));

    850K芯片覆蓋基因啟動(dòng)子區、基因編碼區、CpG島以及增強子區;

    普遍用于復雜疾病甲基化研究,以及大樣本EWAS研究的。

    850K芯片技術(shù)參數

    針對人基因組,檢測853,307個(gè)CpG位點(diǎn),覆蓋CpG島、啟動(dòng)子、編碼區、開(kāi)放染色質(zhì)和增強子;

    同時(shí)采用Infinium I及II探針設計,使檢測范圍更大化;

    單堿基分辨率,可以直接檢測到發(fā)生甲基化的確切位點(diǎn);

    重復性較高,技術(shù)重復相關(guān)性以及與450K相同探針間的相關(guān)性R2 > 0.98;

    起始模板量低,只需 250ng;適用于FFPE樣本。

    樣本類(lèi)型和要求

    樣本類(lèi)型

    樣本要求

    人基因組DNA

    總量≥ 2ug; 濃度≥ 30ng/ul; 基于Qubit定量

    細胞、全血、新鮮冷凍組織等

    按照送樣要求準備

    備注:用封口膜密封樣品; 干冰運輸

    信息分析

    850K芯片

    分析內容

    標準分析

    1.原始數據預處理

    2.數據歸一化(甲基化位點(diǎn)總表,含注釋信息)

    3.QC結果(beta值密度曲線(xiàn),聚類(lèi)圖,PCA圖,相關(guān)性圖)

    4.差異甲基化位點(diǎn)(含注釋信息)

    5.差異甲基化位點(diǎn)的染色體分布

    6.差異甲基化位點(diǎn)的基因功能注釋與富集

    7.差異甲基化位點(diǎn)的熱圖展示

    高級分析

    8、特定基因組區段的DMR展示

    9、甲基化與轉錄的關(guān)聯(lián)分析

    10、其它定制化分析


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    包含了原450K芯片91%的位點(diǎn),又增加了413,745個(gè)位點(diǎn)(總共853,307個(gè)CpG位點(diǎn))
    0755-28507994
    產(chǎn)品介紹

    Illumina甲基化芯片Infinium MethylationEPIC BeadChip(簡(jiǎn)稱(chēng)850K甲基化芯片),

    在原450K芯片的基礎上,推出了新一代的DNA甲基化芯片;

    包含了原450K芯片91%的位點(diǎn),又增加了413,745個(gè)位點(diǎn)(總共853,307個(gè)CpG位點(diǎn));

    850K芯片覆蓋基因啟動(dòng)子區、基因編碼區、CpG島以及增強子區;

    普遍用于復雜疾病甲基化研究,以及大樣本EWAS研究的。

    850K芯片技術(shù)參數

    針對人基因組,檢測853,307個(gè)CpG位點(diǎn),覆蓋CpG島、啟動(dòng)子、編碼區、開(kāi)放染色質(zhì)和增強子;

    同時(shí)采用Infinium I及II探針設計,使檢測范圍更大化;

    單堿基分辨率,可以直接檢測到發(fā)生甲基化的確切位點(diǎn);

    重復性較高,技術(shù)重復相關(guān)性以及與450K相同探針間的相關(guān)性R2 > 0.98;

    起始模板量低,只需 250ng;適用于FFPE樣本。

    樣本類(lèi)型和要求

    樣本類(lèi)型

    樣本要求

    人基因組DNA

    總量≥ 2ug; 濃度≥ 30ng/ul; 基于Qubit定量

    細胞、全血、新鮮冷凍組織等

    按照送樣要求準備

    備注:用封口膜密封樣品; 干冰運輸

    信息分析

    850K芯片

    分析內容

    標準分析

    1.原始數據預處理

    2.數據歸一化(甲基化位點(diǎn)總表,含注釋信息)

    3.QC結果(beta值密度曲線(xiàn),聚類(lèi)圖,PCA圖,相關(guān)性圖)

    4.差異甲基化位點(diǎn)(含注釋信息)

    5.差異甲基化位點(diǎn)的染色體分布

    6.差異甲基化位點(diǎn)的基因功能注釋與富集

    7.差異甲基化位點(diǎn)的熱圖展示

    高級分析

    8、特定基因組區段的DMR展示

    9、甲基化與轉錄的關(guān)聯(lián)分析

    10、其它定制化分析


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