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  • 深圳市艾斯基因科技有限公司
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    深圳市艾斯基因科技有限公司

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    張老師

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    深圳市光明區鳳凰街道鳳凰社區招商局光明科技園A4棟13樓

    甲基化DNA免疫沉淀測序 (MeDIP-seq)

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    ×
    采用甲基化DNA免疫共沉淀技術(shù),通過(guò)5'-甲基胞嘧啶(5mC)抗體特異性富集基因組上發(fā)生甲基化的DNA片段測序
    產(chǎn)品介紹

    甲基化DNA免疫沉淀測序(Methylated DNA Immunoprecipitation Sequencing,MeDIP-Seq),

    采用甲基化DNA免疫共沉淀技術(shù),通過(guò)5'-甲基胞嘧啶(5mC)抗體特異性富集基因組上發(fā)生甲基化的DNA片段測序,

    可以在全基因組水平上進(jìn)行高精度的CpG密集的高甲基化區域研究,

    是分析基因組DNA甲基化變化的一種準確可靠的技術(shù)。

    用心服務(wù)每一個(gè)項目

    艾斯團隊專(zhuān)注表觀(guān)組學(xué)10年,提供專(zhuān)業(yè)有價(jià)值的DNA甲基化完整解決方案;

    最早開(kāi)發(fā)MeDIP-seq技術(shù)團隊之一, 嚴格的內參質(zhì)控;

    已經(jīng)完成人、小鼠、大鼠、豬等多個(gè)物種MeDIP-seq項目經(jīng)驗;

    核心團隊在Nature communications, Genome biology等雜志發(fā)表多篇SCI論文;

    專(zhuān)業(yè)的生物信息分析團隊, 提供更多個(gè)性化分析思路和方案。

    科學(xué)方案設計

    從項目方案、樣本處理、建庫測序,到數據分析;

    每個(gè)項目需要專(zhuān)業(yè)、有價(jià)值的建議;及時(shí)高效的溝通,以保障高質(zhì)量研究成果。

    樣本類(lèi)型和要求

    樣本類(lèi)型/文庫類(lèi)型

    樣本要求

    基因組DNA (TAB-WGBS)

    總量≥ 3ug; 濃度≥ 30ng/ul; 基于Qubit定量

    基因組DNA (TAB-RRBS)

    總量≥ 1ug; 濃度≥ 30ng/ul; 基于Qubit定量

    細胞、全血、新鮮冷凍組織等

    按照送樣要求準備

    備注:用封口膜密封樣品; 干冰運輸

    信息分析

    TAB-seq

    分析內容

    備注

    標準分析

    1、測序數據質(zhì)量評估

    過(guò)濾掉低質(zhì)量數據,保證數據質(zhì)量

    2、氧化率及亞硫酸鹽轉化率評估

    通過(guò)內參進(jìn)行質(zhì)控文庫

    3、與參考基因組比對

    比對率和覆蓋度分析

    4、5hmC位點(diǎn)Calling

    評估胞嘧啶甲基化狀態(tài)

    5、5hmC圖譜分析

    5hmC在基因組、功能元件上的分布

    6、組間差異DhMR分析

    尋找DhMR及注釋

    7、差異5hmC基因分析

    DMG富集分析GO,KEGG

    8、多樣本聚類(lèi)分析

    PCA分析多樣本5hmC變化規律

    高級分析

    9、多組學(xué)整合關(guān)聯(lián)分析

    例如與轉錄組關(guān)聯(lián)分析

    10、其它定制化分析

    結合課題背景亮點(diǎn)挖掘


    甲基化DNA免疫沉淀測序 (MeDIP-seq)

    甲基化DNA免疫沉淀測序 (MeDIP-seq)

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    采用甲基化DNA免疫共沉淀技術(shù),通過(guò)5'-甲基胞嘧啶(5mC)抗體特異性富集基因組上發(fā)生甲基化的DNA片段測序
    0755-28507994
    產(chǎn)品介紹

    甲基化DNA免疫沉淀測序(Methylated DNA Immunoprecipitation Sequencing,MeDIP-Seq),

    采用甲基化DNA免疫共沉淀技術(shù),通過(guò)5'-甲基胞嘧啶(5mC)抗體特異性富集基因組上發(fā)生甲基化的DNA片段測序,

    可以在全基因組水平上進(jìn)行高精度的CpG密集的高甲基化區域研究,

    是分析基因組DNA甲基化變化的一種準確可靠的技術(shù)。

    用心服務(wù)每一個(gè)項目

    艾斯團隊專(zhuān)注表觀(guān)組學(xué)10年,提供專(zhuān)業(yè)有價(jià)值的DNA甲基化完整解決方案;

    最早開(kāi)發(fā)MeDIP-seq技術(shù)團隊之一, 嚴格的內參質(zhì)控;

    已經(jīng)完成人、小鼠、大鼠、豬等多個(gè)物種MeDIP-seq項目經(jīng)驗;

    核心團隊在Nature communications, Genome biology等雜志發(fā)表多篇SCI論文;

    專(zhuān)業(yè)的生物信息分析團隊, 提供更多個(gè)性化分析思路和方案。

    科學(xué)方案設計

    從項目方案、樣本處理、建庫測序,到數據分析;

    每個(gè)項目需要專(zhuān)業(yè)、有價(jià)值的建議;及時(shí)高效的溝通,以保障高質(zhì)量研究成果。

    樣本類(lèi)型和要求

    樣本類(lèi)型/文庫類(lèi)型

    樣本要求

    基因組DNA (TAB-WGBS)

    總量≥ 3ug; 濃度≥ 30ng/ul; 基于Qubit定量

    基因組DNA (TAB-RRBS)

    總量≥ 1ug; 濃度≥ 30ng/ul; 基于Qubit定量

    細胞、全血、新鮮冷凍組織等

    按照送樣要求準備

    備注:用封口膜密封樣品; 干冰運輸

    信息分析

    TAB-seq

    分析內容

    備注

    標準分析

    1、測序數據質(zhì)量評估

    過(guò)濾掉低質(zhì)量數據,保證數據質(zhì)量

    2、氧化率及亞硫酸鹽轉化率評估

    通過(guò)內參進(jìn)行質(zhì)控文庫

    3、與參考基因組比對

    比對率和覆蓋度分析

    4、5hmC位點(diǎn)Calling

    評估胞嘧啶甲基化狀態(tài)

    5、5hmC圖譜分析

    5hmC在基因組、功能元件上的分布

    6、組間差異DhMR分析

    尋找DhMR及注釋

    7、差異5hmC基因分析

    DMG富集分析GO,KEGG

    8、多樣本聚類(lèi)分析

    PCA分析多樣本5hmC變化規律

    高級分析

    9、多組學(xué)整合關(guān)聯(lián)分析

    例如與轉錄組關(guān)聯(lián)分析

    10、其它定制化分析

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